IL-6在多種疾病時有明顯改變，其表達失調可引起許多疾病，其臨床表現主要為發病時IL-6水準增高。在發生內外傷、外科手術，應激反應，感染，腦死亡，腫瘤產生以及其它情況的急性炎症反應過程中IL-6會快速生成。手術病人的IL-6濃度能夠預示是否會有手術併發症的產生。
連續檢測重症監護病人血清或血漿中IL-6的水準能有效的評估系統性炎症反應綜合症（SIRS）的嚴重程度，膿毒血症以及膿毒血症性休克的預後情況。IL-6的血清濃度水準增高早於PCT和CRP，能作為膿毒血症的早期警告指標。IL-6還在慢性炎症反應（如類風濕關節炎）中扮演著重要角色。